MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Puno120 chromosome

Total Repeats: 33942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017378	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385227774
2	NC_017378	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	385227774
3	NC_017378	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227774
4	NC_017378	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	385227774
5	NC_017378	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227774
6	NC_017378	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385227774
7	NC_017378	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385227774
8	NC_017378	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227774
9	NC_017378	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227774
10	NC_017378	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227774
11	NC_017378	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385227774
12	NC_017378	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385227775
13	NC_017378	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385227775
14	NC_017378	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385227775
15	NC_017378	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227775
16	NC_017378	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227775
17	NC_017378	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385227775
18	NC_017378	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227775
19	NC_017378	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385227775
20	NC_017378	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385227776
21	NC_017378	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227776
22	NC_017378	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385227776
23	NC_017378	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227776
24	NC_017378	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385227776
25	NC_017378	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	385227776
26	NC_017378	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	385227776
27	NC_017378	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	385227776
28	NC_017378	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385227776
29	NC_017378	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385227776
30	NC_017378	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385227776
31	NC_017378	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	385227776
32	NC_017378	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	385227776
33	NC_017378	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385227776
34	NC_017378	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227776
35	NC_017378	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227777
36	NC_017378	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	385227777
37	NC_017378	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385227777
38	NC_017378	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385227777
39	NC_017378	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385227777
40	NC_017378	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227777
41	NC_017378	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385227777
42	NC_017378	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227777
43	NC_017378	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385227777
44	NC_017378	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	385227777
45	NC_017378	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227777
46	NC_017378	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385227777
47	NC_017378	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227777
48	NC_017378	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385227777
49	NC_017378	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227777
50	NC_017378	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385227777
51	NC_017378	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	385227777
52	NC_017378	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385227777
53	NC_017378	GTTTT	2	10	2427	2436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017378	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017378	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	385227778
56	NC_017378	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385227778
57	NC_017378	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	385227778
58	NC_017378	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	385227778
59	NC_017378	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385227778
60	NC_017378	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	385227778
61	NC_017378	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	385227778
62	NC_017378	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227778
63	NC_017378	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	385227778
64	NC_017378	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385227778
65	NC_017378	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227778
66	NC_017378	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	385227778
67	NC_017378	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385227778
68	NC_017378	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385227778
69	NC_017378	AG	3	6	3251	3256	50 %	0 %	50 %	0 %	385227779
70	NC_017378	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385227779
71	NC_017378	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	385227779
72	NC_017378	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	385227779
73	NC_017378	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227779
74	NC_017378	A	6	6	3639	3644	100 %	0 %	0 %	0 %	385227779
75	NC_017378	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227779
76	NC_017378	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	385227779
77	NC_017378	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	385227779
78	NC_017378	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385227779
79	NC_017378	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385227779
80	NC_017378	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017378	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017378	TGG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017378	ATGC	2	8	4281	4288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017378	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017378	GTG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017378	ACC	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017378	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017378	A	7	7	4579	4585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017378	T	8	8	4599	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017378	AAT	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017378	GAAAC	2	10	4649	4658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017378	TAAA	2	8	4689	4696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017378	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017378	TGT	2	6	4749	4754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017378	ATT	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017378	T	7	7	4831	4837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017378	A	6	6	4842	4847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017378	A	6	6	4858	4863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017378	TGT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017378	TTTTA	2	10	4922	4931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017378	TC	3	6	4967	4972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017378	A	8	8	5000	5007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017378	A	8	8	5016	5023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017378	A	6	6	5034	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017378	GCTT	2	8	5231	5238	0 %	50 %	25 %	25 %	385227780
106	NC_017378	T	6	6	5237	5242	0 %	100 %	0 %	0 %	385227780
107	NC_017378	CATT	2	8	5302	5309	25 %	50 %	0 %	25 %	385227780
108	NC_017378	ATT	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385227780
109	NC_017378	A	6	6	5534	5539	100 %	0 %	0 %	0 %	385227780
110	NC_017378	C	6	6	5554	5559	0 %	0 %	0 %	100 %	385227780
111	NC_017378	A	6	6	5576	5581	100 %	0 %	0 %	0 %	385227780
112	NC_017378	GTT	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227780
113	NC_017378	TAA	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385227780
114	NC_017378	TTA	2	6	5751	5756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385227780
115	NC_017378	GTG	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385227780
116	NC_017378	GTT	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227780
117	NC_017378	GTGC	2	8	5880	5887	0 %	25 %	50 %	25 %	385227780
118	NC_017378	TCT	2	6	5964	5969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227780
119	NC_017378	C	6	6	5986	5991	0 %	0 %	0 %	100 %	385227780
120	NC_017378	ATG	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227780
121	NC_017378	AGT	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227780
122	NC_017378	AGA	2	6	6170	6175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227780
123	NC_017378	AC	3	6	6311	6316	50 %	0 %	0 %	50 %	385227780
124	NC_017378	CTT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227780
125	NC_017378	TAG	5	15	6445	6459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227780
126	NC_017378	TGT	2	6	6488	6493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227780
127	NC_017378	GTT	2	6	6521	6526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227780
128	NC_017378	TTG	2	6	6554	6559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227780
129	NC_017378	CTGG	2	8	6670	6677	0 %	25 %	50 %	25 %	385227780
130	NC_017378	TTG	2	6	6695	6700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227780
131	NC_017378	CCG	2	6	6757	6762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385227780
132	NC_017378	ATCG	2	8	6845	6852	25 %	25 %	25 %	25 %	385227780
133	NC_017378	GCT	2	6	6872	6877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385227780
134	NC_017378	CGTT	2	8	6880	6887	0 %	50 %	25 %	25 %	385227780
135	NC_017378	A	6	6	7019	7024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017378	GA	4	8	7058	7065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017378	T	7	7	7076	7082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017378	TGT	2	6	7204	7209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227781
139	NC_017378	A	7	7	7213	7219	100 %	0 %	0 %	0 %	385227781
140	NC_017378	T	7	7	7222	7228	0 %	100 %	0 %	0 %	385227781
141	NC_017378	AG	3	6	7258	7263	50 %	0 %	50 %	0 %	385227781
142	NC_017378	TGT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017378	AG	3	6	7342	7347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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